1985-1986年，王文兴主持了我国第一次全国酸雨调查研究，这次全国性的酸雨观测是国家“六五”攻关期间环保科技重大科研项目。当时的国际背景是欧洲和美国的酸雨污染已经成为环保中比较棘手的重大问题：中国酸雨的整体状况怎么样?这次研究的目的就是要查明我国酸雨污染的基本状况。虽然“六五”攻关项目历时短，经费紧张，导致研究不够深入，但依然获得了全国酸雨情况的基本面貌和许多宝贵的基础数据。从1986年至1990年，王文兴主持了“七五”国家酸雨研究课题，主要针对我国典型地区的酸雨进行研究，并取得了较好的成果。研究表明，在两广地区的降水酸性急剧升高、面积迅速扩大。“七五”期间的重要目标是解决新发现的重酸雨区的问题，即研究华南地区酸雨的时空分布、形成机制、大气传输、生态和环境影响以及针对华南地区存在的酸雨污染问愿能出控制对策。自此，通过前两项研究掌握了酸雨污染的典型事例，为进一步解决全国酸两何题打下了坚实基础，并为“八五”立项作出了科学准备。基于此，国务院环委会决定在“八五”期间继续列项，深入开展酸雨研究，以期查明我国整体酸雨现状及其对生态环境的影响。1991年2月，国家环保局、
国家科委、国家教委与中国科学院协调决定成立以王文兴为组长的“八五”酸雨科技攻关项目领导组，编制可行性论证报告。酸雨是“八五”的研究重点，国家在科研人员的配备和经费方面都给予了良好的支持。从研究的深度和广度来说，“八五”应该是酸雨研究的高峰时期。
根据王文兴的工作日记记载，为进一步深入全面地查明我国的酸雨问题，相关研究人员在“七五”项目后期就开始不断向国家环保局反映“八五”期间酸雨继续列项的必要性。
1990年2月23日，国家科委召开会议，有关领导到会部署“八五”酸雨项目立项的准备工作要求，强调由于酸雨研究涉及学科多，要用系统工程的观点进行课题设计。两天后再次召开酸雨会议，要求两天内提出可行性方案。经国家环保局讨论，7月29日，又一次召开酸雨立项协调会议，这次会议是推动“八五”攻关项目论证会的关键，特别强调酸雨研究的重要性，要求两天内进一步提出“八五”酸雨研究可行性方案。
1991年2月12日，国家环保局召开“八五”国家科技攻关项目预备会，到会专家有冯宗伟、唐孝炎、蒋大和、郝吉明、秦文娟、任阵海、黄美元等。周思毅处长宣布：“八五”国家科技攻关项目有关酸雨研究，国家科委已决定立项，不日下文，现在要抓紧时间组织临时领导班子。经国家环保局与中国环境科学研究院、国家教委协商，“八五”国家科技攻关酸雨项目组长一人，副组长两人，组长由王文兴担任，副组长由冯宗伟、唐孝炎担任。由王文兴负责编制“八五”酸雨攻关可行性报告。王文兴提议由环境科学研究院曹洪发任项目组秘书。
周思毅还说道：“八五”攻关立项很不容易，“七五”攻关的完成为其奠定了形势写了一篇新华社内参，引起时任国务院总理李鹏的重视，批转国家环保委员会，也起了一定推动作用。到会专家兴奋地表示，酸雨研究项目能立项对环保至关重要，并认为该项目将对我国酸雨控制起重要作用，建议酸雨研究应有长期计划，研究范围应扩大到全国，研究领域应拓宽深入至监测、排放源、长距离传输、土壤酸化、森林破坏、水体酸化、水生生物影响、文物材料破坏和控制对策等项目。
王文兴在“七五”攻关的主要成果中写道：两广地区酸沉降已经对陆地生态系统造成了严重的威胁，由此引起的经济损失也十分严重。然而，就全国范围而言，我们对酸沉降在不同气候和地理条件下的影响情况还不了解，对酸沉降潜在的长期影响还没有足够的依据进行预测。
例如酸雨、二氧化硫和臭氧等主要大气污染物对生态系统的复合效应问题，如何有效地利用生态系统的自我调节和人工调节，缓冲或减少酸沉降造成的危害和经济损失等，都需要作进一步的研究。在总结“七五”成果之后，王文兴写出了“八五”攻关的相关建议。
根据“七五”研究的结果、经验和国外有关资料，酸沉降对陆地生态系统的影响具有多危害、面积大、时效长等特点，尤其是酸沉降与其他因素（如是氧）产生复合作用时，其准害将进一步加剧。因此，需要进一步查湾我国陆地生态系统受酸雨和臭氧危害的程度及分布范围，以便更准确地信算由此造成的经济损失和发展趋势，提出符合我国国情、易于在广大酸沉降地区实施应用的防治对策。王文兴建议在“八五”期间除继续深入研究“七五”期间的部分课题外，还必须增加一些新的研究内容，以全面评价酸沉降和臭氧等大气污染物对我国陆地生态系统的影响。具体研究内容如下：
多因素复合型污染（酸雨、臭氧）对主要农作物生长和产量的影响。研究内容包括：主要大田作物生长和产量的影响及区域经济损益分析、抗性农作物品种筛选、农田大区环境质量规划及有效的栽培管理措施。
多因素复合污染物对主要林木生长和生物量的影响。研究内容包括：不同气候条件下（纬度和海拔高度）林木生长和生物量与多因素复合污染物的关系、区域林业经济损益分析、森林病虫害与酸沉降的关系、抗性树种的筛选及抚育管理措施。
多因素复合污染物对土壤和水体的影响。研究内容包括：不同类型土壤和水体酸化的机理和过程、土壤和水体敏感性区划及发展趋势预测及由此造成的经济损失评价。
多因素复合污染物对人体健康的影响。研究内容包括：通过食物链进入生态系统循环的有毒有害元素对人体健康的影响及由此造成的社会经济损失评价。
我国在“六五”“七五”期间进行的前两个酸雨项目，项目名称中都用“酸雨”一词，但“八五”项目不叫“酸雨”而改用“酸沉降”，“酸雨”一词从19世纪沿用下来，是大气酸化现象的俗称，“酸沉降”（AcidPrecipitation）这个词在学术上更能准确地概括大气中酸性物质以各种形式的沉降，如降水、降雪、雾、露等以湿的形式沉降到地面，它还包括酸性气体、含酸性物质颗粒的干沉降。在学术界，一些大型科研项目都用酸沉降这个词，例如“美国国家酸沉降计划”。
为了保证“八五”课题顺利通过审查，王文兴对研究力量和现有基础加以说明，主要有几个方面：拥有国内领先的酸沉降和其他气态污染物对生物影响的模拟实验设备，包括生态温室、CSTR动态熏气系统、开顶式野外模拟熏气、喷淋系统、水生生态模拟实验室、生物分析、化学分析和仪器分析常规实验室；在前期工作的基础上，建立了酸沉降引起森林经济损失分析模型、农业经济损失分析模型、水体酸化模拟及预测模型、土壤酸化模拟方法及预测模型；拥有一支具有多年研究经验的科技队伍；在学科专业配套方面，具有农学、生物学、生态学、环境化学、化学、数学及计算机等多学科。
1991年8月8日，国家科委召开会议，对王文兴等提出的“八五”课题“我国酸沉降及其生态环境影响研究”可行性报告进行论证。项目的专家委员认为，该项目在“六五”“七五”攻关项目研究成果的基础上，将对我国东部地区酸沉降及其影响和控制技术进行更深入的研究，为控制酸沉降的危害、保护生态环境作出贡献。该项目的立题和计划内容，在科学性、配套性、实用性及水平方面是合乎“八五”攻关立题要求的。
1992年4月10日，王文兴作为课题负责人，签署了“八五”《国家科技攻关计划专题合同》，担任国家“八五”环保科技攻关项目“我国酸沉降及其生态环境影响研究”项目组组长。8月20日，国家环保局下文，将“七五”国家环保科技攻关办公室更名为“八五”国家环保科技攻关办公室，明确规定：该办公室的职能及工作范围参照原“七五”攻关办公室的有关规定办理。
“八五”国家环保科技攻关课题的主要研究任务是全面查清我国酸定降现状和发展趋势，提供酸沉降对森林、农业和土壤的影响及其造成的经济损失，研究我国大气输送规律，定量地求得省区间和跨国输送量和沉降量，阐明大气酸化和沉降过程的机制和规律，并在此基础上提出适合我国的酸沉降控制规划和对策。
由王文兴主持的“八五”环保科技攻关项目“我国酸沉降及其生态环境影响研究”，有国家环保系统、中国科学院、高等院校、气象系统和水利系统等数十个单位参加，科研人力投入超过2000人，是一项涉及众多区域、众多学科的大型综合性研究课题。在经历了多年的丰富积累和脚踏实地的艰苦攀登后，王文兴开始步入他科研事业的巅峰阶段。
“我国酸沉降及其生态环境影响研究”项目课题设计，是王文兴积多年酸雨研究之经验和全面深入的思考，历经两个月完成的，它包括相互联系和依存的五个专题（含31个子课题，后归结为30个），即：我国酸沉降时空分布规律的研究；我国酸沉降及其生态环境影响的研究；我国酸性物质大气输送过程的研究；我国大气酸化和酸沉降过程的研究；我国酸沉降控制规划和对策的研究。
这五个专题从不同的方面运用和开拓各自的学科知识，在逻辑上相互衔接、渗透，共同解决我国酸沉降危害这一综合性、区域性环境问题。
“酸沉降”是指大气中的酸性物质以降水的形式或者在气流作用下迁移到地面的过程，包括“湿沉降”和“干沉降”。湿沉降通常指pH值低于5.6的降水，包括雨、雪、雾、冰雹等各种降水形式，最常见的就是酸雨，这种降水过程称为湿沉降。干沉降是指大气中的酸性物质在气流的作用下直接迁移到地面的过程。酸沉降发生的范围是区域性的，形成是多因素的，产生的危害是链锁的，生态环境破坏的恢复是滞后性的，其研究具有明显的多学科特征。
王文兴所做的课题设计突出了利用多学科攻关的特点，从不同领域和多方面去研究解决我国酸沉降方面的重大关键问题。五个专题中每一方面都含有自己独特的若干层次，呈现出课题复杂的多层次结构，在科学上，它构成了一个庞大的系统工程。另外，本课题的指导思想也体现了基础学科的研究为解决实际问题服务，反过来服务带动学科的发展。
1985-1986年，王文兴主持了我国第一次全国酸雨调查研究，这次全国性的酸雨观测是国家“六五”攻关期间环保科技重大科研项目。当时的国际背景是欧洲和美国的酸雨污染已经成为环保中比较棘手的重大问题：中国酸雨的整体状况怎么样?这次研究的目的就是要查明我国酸雨污染的基本状况。虽然“六五”攻关项目历时短，经费紧张，导致研究不够深入，但依然获得了全国酸雨情况的基本面貌和许多宝贵的基础数据。从1986年至1990年，王文兴主持了“七五”国家酸雨研究课题，主要针对我国典型地区的酸雨进行研究，并取得了较好的成果。研究表明，在两广地区的降水酸性急剧升高、面积迅速扩大。“七五”期间的重要目标是解决新发现的重酸雨区的问题，即研究华南地区酸雨的时空分布、形成机制、大气传输、生态和环境影响以及针对华南地区存在的酸雨污染问愿能出控制对策。自此，通过前两项研究掌握了酸雨污染的典型事例，为进一步解决全国酸两何题打下了坚实基础，并为“八五”立项作出了科学准备。基于此，国务院环委会决定在“八五”期间继续列项，深入开展酸雨研究，以期查明我国整体酸雨现状及其对生态环境的影响。1991年2月，国家环保局、
国家科委、国家教委与中国科学院协调决定成立以王文兴为组长的“八五”酸雨科技攻关项目领导组，编制可行性论证报告。酸雨是“八五”的研究重点，国家在科研人员的配备和经费方面都给予了良好的支持。从研究的深度和广度来说，“八五”应该是酸雨研究的高峰时期。
根据王文兴的工作日记记载，为进一步深入全面地查明我国的酸雨问题，相关研究人员在“七五”项目后期就开始不断向国家环保局反映“八五”期间酸雨继续列项的必要性。
1990年2月23日，国家科委召开会议，有关领导到会部署“八五”酸雨项目立项的准备工作要求，强调由于酸雨研究涉及学科多，要用系统工程的观点进行课题设计。两天后再次召开酸雨会议，要求两天内提出可行性方案。经国家环保局讨论，7月29日，又一次召开酸雨立项协调会议，这次会议是推动“八五”攻关项目论证会的关键，特别强调酸雨研究的重要性，要求两天内进一步提出“八五”酸雨研究可行性方案。
1991年2月12日，国家环保局召开“八五”国家科技攻关项目预备会，到会专家有冯宗伟、唐孝炎、蒋大和、郝吉明、秦文娟、任阵海、黄美元等。周思毅处长宣布：“八五”国家科技攻关项目有关酸雨研究，国家科委已决定立项，不日下文，现在要抓紧时间组织临时领导班子。经国家环保局与中国环境科学研究院、国家教委协商，“八五”国家科技攻关酸雨项目组长一人，副组长两人，组长由王文兴担任，副组长由冯宗伟、唐孝炎担任。由王文兴负责编制“八五”酸雨攻关可行性报告。王文兴提议由环境科学研究院曹洪发任项目组秘书。
周思毅还说道：“八五”攻关立项很不容易，“七五”攻关的完成为其奠定了形势写了一篇新华社内参，引起时任国务院总理李鹏的重视，批转国家环保委员会，也起了一定推动作用。到会专家兴奋地表示，酸雨研究项目能立项对环保至关重要，并认为该项目将对我国酸雨控制起重要作用，建议酸雨研究应有长期计划，研究范围应扩大到全国，研究领域应拓宽深入至监测、排放源、长距离传输、土壤酸化、森林破坏、水体酸化、水生生物影响、文物材料破坏和控制对策等项目。
王文兴在“七五”攻关的主要成果中写道：两广地区酸沉降已经对陆地生态系统造成了严重的威胁，由此引起的经济损失也十分严重。然而，就全国范围而言，我们对酸沉降在不同气候和地理条件下的影响情况还不了解，对酸沉降潜在的长期影响还没有足够的依据进行预测。
例如酸雨、二氧化硫和臭氧等主要大气污染物对生态系统的复合效应问题，如何有效地利用生态系统的自我调节和人工调节，缓冲或减少酸沉降造成的危害和经济损失等，都需要作进一步的研究。在总结“七五”成果之后，王文兴写出了“八五”攻关的相关建议。
根据“七五”研究的结果、经验和国外有关资料，酸沉降对陆地生态系统的影响具有多危害、面积大、时效长等特点，尤其是酸沉降与其他因素（如是氧）产生复合作用时，其准害将进一步加剧。因此，需要进一步查湾我国陆地生态系统受酸雨和臭氧危害的程度及分布范围，以便更准确地信算由此造成的经济损失和发展趋势，提出符合我国国情、易于在广大酸沉降地区实施应用的防治对策。王文兴建议在“八五”期间除继续深入研究“七五”期间的部分课题外，还必须增加一些新的研究内容，以全面评价酸沉降和臭氧等大气污染物对我国陆地生态系统的影响。具体研究内容如下：
多因素复合型污染（酸雨、臭氧）对主要农作物生长和产量的影响。研究内容包括：主要大田作物生长和产量的影响及区域经济损益分析、抗性农作物品种筛选、农田大区环境质量规划及有效的栽培管理措施。
多因素复合污染物对主要林木生长和生物量的影响。研究内容包括：不同气候条件下（纬度和海拔高度）林木生长和生物量与多因素复合污染物的关系、区域林业经济损益分析、森林病虫害与酸沉降的关系、抗性树种的筛选及抚育管理措施。
多因素复合污染物对土壤和水体的影响。研究内容包括：不同类型土壤和水体酸化的机理和过程、土壤和水体敏感性区划及发展趋势预测及由此造成的经济损失评价。
多因素复合污染物对人体健康的影响。研究内容包括：通过食物链进入生态系统循环的有毒有害元素对人体健康的影响及由此造成的社会经济损失评价。
我国在“六五”“七五”期间进行的前两个酸雨项目，项目名称中都用“酸雨”一词，但“八五”项目不叫“酸雨”而改用“酸沉降”，“酸雨”一词从19世纪沿用下来，是大气酸化现象的俗称，“酸沉降”（AcidPrecipitation）这个词在学术上更能准确地概括大气中酸性物质以各种形式的沉降，如降水、降雪、雾、露等以湿的形式沉降到地面，它还包括酸性气体、含酸性物质颗粒的干沉降。在学术界，一些大型科研项目都用酸沉降这个词，例如“美国国家酸沉降计划”。
为了保证“八五”课题顺利通过审查，王文兴对研究力量和现有基础加以说明，主要有几个方面：拥有国内领先的酸沉降和其他气态污染物对生物影响的模拟实验设备，包括生态温室、CSTR动态熏气系统、开顶式野外模拟熏气、喷淋系统、水生生态模拟实验室、生物分析、化学分析和仪器分析常规实验室；在前期工作的基础上，建立了酸沉降引起森林经济损失分析模型、农业经济损失分析模型、水体酸化模拟及预测模型、土壤酸化模拟方法及预测模型；拥有一支具有多年研究经验的科技队伍；在学科专业配套方面，具有农学、生物学、生态学、环境化学、化学、数学及计算机等多学科。
1991年8月8日，国家科委召开会议，对王文兴等提出的“八五”课题“我国酸沉降及其生态环境影响研究”可行性报告进行论证。项目的专家委员认为，该项目在“六五”“七五”攻关项目研究成果的基础上，将对我国东部地区酸沉降及其影响和控制技术进行更深入的研究，为控制酸沉降的危害、保护生态环境作出贡献。该项目的立题和计划内容，在科学性、配套性、实用性及水平方面是合乎“八五”攻关立题要求的。
1992年4月10日，王文兴作为课题负责人，签署了“八五”《国家科技攻关计划专题合同》，担任国家“八五”环保科技攻关项目“我国酸沉降及其生态环境影响研究”项目组组长。8月20日，国家环保局下文，将“七五”国家环保科技攻关办公室更名为“八五”国家环保科技攻关办公室，明确规定：该办公室的职能及工作范围参照原“七五”攻关办公室的有关规定办理。
“八五”国家环保科技攻关课题的主要研究任务是全面查清我国酸定降现状和发展趋势，提供酸沉降对森林、农业和土壤的影响及其造成的经济损失，研究我国大气输送规律，定量地求得省区间和跨国输送量和沉降量，阐明大气酸化和沉降过程的机制和规律，并在此基础上提出适合我国的酸沉降控制规划和对策。
由王文兴主持的“八五”环保科技攻关项目“我国酸沉降及其生态环境影响研究”，有国家环保系统、中国科学院、高等院校、气象系统和水利系统等数十个单位参加，科研人力投入超过2000人，是一项涉及众多区域、众多学科的大型综合性研究课题。在经历了多年的丰富积累和脚踏实地的艰苦攀登后，王文兴开始步入他科研事业的巅峰阶段。
“我国酸沉降及其生态环境影响研究”项目课题设计，是王文兴积多年酸雨研究之经验和全面深入的思考，历经两个月完成的，它包括相互联系和依存的五个专题（含31个子课题，后归结为30个），即：我国酸沉降时空分布规律的研究；我国酸沉降及其生态环境影响的研究；我国酸性物质大气输送过程的研究；我国大气酸化和酸沉降过程的研究；我国酸沉降控制规划和对策的研究。
这五个专题从不同的方面运用和开拓各自的学科知识，在逻辑上相互衔接、渗透，共同解决我国酸沉降危害这一综合性、区域性环境问题。
“酸沉降”是指大气中的酸性物质以降水的形式或者在气流作用下迁移到地面的过程，包括“湿沉降”和“干沉降”。湿沉降通常指pH值低于5.6的降水，包括雨、雪、雾、冰雹等各种降水形式，最常见的就是酸雨，这种降水过程称为湿沉降。干沉降是指大气中的酸性物质在气流的作用下直接迁移到地面的过程。酸沉降发生的范围是区域性的，形成是多因素的，产生的危害是链锁的，生态环境破坏的恢复是滞后性的，其研究具有明显的多学科特征。
王文兴所做的课题设计突出了利用多学科攻关的特点，从不同领域和多方面去研究解决我国酸沉降方面的重大关键问题。五个专题中每一方面都含有自己独特的若干层次，呈现出课题复杂的多层次结构，在科学上，它构成了一个庞大的系统工程。另外，本课题的指导思想也体现了基础学科的研究为解决实际问题服务，反过来服务带动学科的发展。